Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Mark1Q8VHJ5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mark1Q8VHJ5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mark1Q8VHJ5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mark1Q8VHJ5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mark1Q8VHJ5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mark1Q8VHJ5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mark1Q8VHJ5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mark1Q8VHJ5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mark1Q8VHJ5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mark1Q8VHJ5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mark1Q8VHJ5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mark1Q8VHJ5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mark1Q8VHJ5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Mark1Q8VHJ5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mark1Q8VHJ5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mark1Q8VHJ5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mark1Q8VHJ5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mark1Q8VHJ5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mark1Q8VHJ5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mark1Q8VHJ5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mark1Q8VHJ5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms