Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf4Q8VE97 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf4Q8VE97 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf4Q8VE97 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms