Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Cul7Q8VE73 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cul7Q8VE73 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms