Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnajc28Q8VCE1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnajc28Q8VCE1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnajc28Q8VCE1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnajc28Q8VCE1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dnajc28Q8VCE1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dnajc28Q8VCE1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dnajc28Q8VCE1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnajc28Q8VCE1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms