Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Treml1Q8K558 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Treml1Q8K558 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Treml1Q8K558 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Treml1Q8K558 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Treml1Q8K558 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Treml1Q8K558 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Treml1Q8K558 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Treml1Q8K558 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Treml1Q8K558 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Treml1Q8K558 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Treml1Q8K558 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Treml1Q8K558 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Treml1Q8K558 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Treml1Q8K558 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Treml1Q8K558 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Treml1Q8K558 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Treml1Q8K558 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Treml1Q8K558 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Treml1Q8K558 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Treml1Q8K558 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Treml1Q8K558 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Treml1Q8K558 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Treml1Q8K558 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms