Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx8Q8CFD4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms