Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9F4

Gm9949, Predicted gene 9949, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9949Q8C9F4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm9949Q8C9F4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm9949Q8C9F4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm9949Q8C9F4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm9949Q8C9F4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm9949Q8C9F4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm9949Q8C9F4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm9949Q8C9F4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm9949Q8C9F4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm9949Q8C9F4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm9949Q8C9F4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm9949Q8C9F4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm9949Q8C9F4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm9949Q8C9F4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm9949Q8C9F4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm9949Q8C9F4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm9949Q8C9F4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm9949Q8C9F4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm9949Q8C9F4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm9949Q8C9F4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm9949Q8C9F4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm9949Q8C9F4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm9949Q8C9F4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm9949Q8C9F4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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