Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dclre1bQ8C7W7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dclre1bQ8C7W7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms