Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY89

Slc44a2, Choline transporter-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a2Q8BY89 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a2Q8BY89 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Slc44a2Q8BY89 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Slc44a2Q8BY89 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a2Q8BY89 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a2Q8BY89 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a2Q8BY89 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a2Q8BY89 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a2Q8BY89 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a2Q8BY89 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a2Q8BY89 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a2Q8BY89 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a2Q8BY89 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a2Q8BY89 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a2Q8BY89 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a2Q8BY89 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a2Q8BY89 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a2Q8BY89 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a2Q8BY89 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a2Q8BY89 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a2Q8BY89 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a2Q8BY89 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a2Q8BY89 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms