Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms