Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms