Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLF2

Cdkl3, Cyclin-dependent kinase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl3Q8BLF2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl3Q8BLF2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms