Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rufy1Q8BIJ7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rufy1Q8BIJ7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms