Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-M10.2Q85ZW9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-M10.2Q85ZW9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-M10.2Q85ZW9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-M10.2Q85ZW9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M10.2Q85ZW9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M10.2Q85ZW9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M10.2Q85ZW9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M10.2Q85ZW9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M10.2Q85ZW9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M10.2Q85ZW9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M10.2Q85ZW9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M10.2Q85ZW9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M10.2Q85ZW9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M10.2Q85ZW9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M10.2Q85ZW9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M10.2Q85ZW9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M10.2Q85ZW9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M10.2Q85ZW9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
H2-M10.2Q85ZW9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
H2-M10.2Q85ZW9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.2Q85ZW9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms