Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms