Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc172Q810N9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc172Q810N9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc172Q810N9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc172Q810N9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc172Q810N9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc172Q810N9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms