Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc155Q80VJ8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms