Protein–RNA interactions for Protein: Q80V91

Dtx3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3Q80V91 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dtx3Q80V91 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dtx3Q80V91 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms