Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms