Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmed3Q78IS1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms