Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2eQ6VUP9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms