Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casc1Q6TDU8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms