Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Neil2Q6R2P8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms