Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF93

Pik3c3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c3Q6PF93 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pik3c3Q6PF93 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms