Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE3

Rrm2b, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm2bQ6PEE3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrm2bQ6PEE3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms