Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 461.1 ms