Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mfsd13aQ6PDE8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms