Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frg2f1Q6P3A2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frg2f1Q6P3A2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Frg2f1Q6P3A2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frg2f1Q6P3A2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frg2f1Q6P3A2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frg2f1Q6P3A2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frg2f1Q6P3A2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frg2f1Q6P3A2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Frg2f1Q6P3A2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frg2f1Q6P3A2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frg2f1Q6P3A2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frg2f1Q6P3A2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frg2f1Q6P3A2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frg2f1Q6P3A2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frg2f1Q6P3A2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frg2f1Q6P3A2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frg2f1Q6P3A2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frg2f1Q6P3A2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frg2f1Q6P3A2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frg2f1Q6P3A2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frg2f1Q6P3A2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frg2f1Q6P3A2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frg2f1Q6P3A2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frg2f1Q6P3A2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frg2f1Q6P3A2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frg2f1Q6P3A2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms