Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1I3

KICSTOR complex protein C12orf66 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P1I3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6P1I3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6P1I3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6P1I3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P1I3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6P1I3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6P1I3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P1I3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P1I3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P1I3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6P1I3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6P1I3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q6P1I3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms