Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms