Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms