Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6GQU0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6GQU0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6GQU0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6GQU0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q6GQU0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6GQU0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6GQU0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6GQU0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6GQU0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6GQU0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6GQU0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms