Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VclQ64727 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VclQ64727 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VclQ64727 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VclQ64727 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VclQ64727 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VclQ64727 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VclQ64727 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VclQ64727 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VclQ64727 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VclQ64727 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VclQ64727 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VclQ64727 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VclQ64727 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VclQ64727 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VclQ64727 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VclQ64727 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VclQ64727 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VclQ64727 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VclQ64727 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VclQ64727 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VclQ64727 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VclQ64727 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VclQ64727 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VclQ64727 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VclQ64727 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VclQ64727 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VclQ64727 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VclQ64727 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VclQ64727 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VclQ64727 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VclQ64727 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VclQ64727 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VclQ64727 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VclQ64727 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VclQ64727 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VclQ64727 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VclQ64727 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VclQ64727 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VclQ64727 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VclQ64727 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VclQ64727 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VclQ64727 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VclQ64727 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VclQ64727 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VclQ64727 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VclQ64727 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VclQ64727 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VclQ64727 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VclQ64727 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VclQ64727 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VclQ64727 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VclQ64727 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VclQ64727 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VclQ64727 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VclQ64727 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VclQ64727 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VclQ64727 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VclQ64727 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VclQ64727 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VclQ64727 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VclQ64727 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VclQ64727 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VclQ64727 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VclQ64727 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VclQ64727 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VclQ64727 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VclQ64727 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VclQ64727 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VclQ64727 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VclQ64727 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VclQ64727 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VclQ64727 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VclQ64727 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VclQ64727 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VclQ64727 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VclQ64727 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VclQ64727 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VclQ64727 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VclQ64727 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VclQ64727 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VclQ64727 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VclQ64727 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VclQ64727 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VclQ64727 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VclQ64727 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VclQ64727 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VclQ64727 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VclQ64727 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VclQ64727 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VclQ64727 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VclQ64727 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VclQ64727 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VclQ64727 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VclQ64727 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VclQ64727 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VclQ64727 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VclQ64727 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VclQ64727 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VclQ64727 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms