Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pou4f3Q63955 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f3Q63955 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f3Q63955 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f3Q63955 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f3Q63955 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f3Q63955 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f3Q63955 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f3Q63955 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f3Q63955 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f3Q63955 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f3Q63955 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f3Q63955 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f3Q63955 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f3Q63955 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f3Q63955 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f3Q63955 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f3Q63955 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f3Q63955 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou4f3Q63955 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou4f3Q63955 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms