Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn4Q62472 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn4Q62472 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn4Q62472 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn4Q62472 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn4Q62472 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn4Q62472 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn4Q62472 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn4Q62472 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms