Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lcn3Q62471 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms