Protein–RNA interactions for Protein: Q62441

Tle4, Transducin-like enhancer protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tle4Q62441 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tle4Q62441 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tle4Q62441 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tle4Q62441 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tle4Q62441 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tle4Q62441 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tle4Q62441 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tle4Q62441 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tle4Q62441 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tle4Q62441 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tle4Q62441 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tle4Q62441 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tle4Q62441 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tle4Q62441 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tle4Q62441 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tle4Q62441 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tle4Q62441 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tle4Q62441 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tle4Q62441 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tle4Q62441 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tle4Q62441 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tle4Q62441 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tle4Q62441 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tle4Q62441 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tle4Q62441 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tle4Q62441 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tle4Q62441 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms