Protein–RNA interactions for Protein: Q62266

Sprr1a, Cornifin-A, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1aQ62266 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1aQ62266 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1aQ62266 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1aQ62266 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1aQ62266 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1aQ62266 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1aQ62266 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1aQ62266 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1aQ62266 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1aQ62266 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1aQ62266 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1aQ62266 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1aQ62266 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1aQ62266 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1aQ62266 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1aQ62266 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1aQ62266 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1aQ62266 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1aQ62266 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1aQ62266 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1aQ62266 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1aQ62266 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1aQ62266 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1aQ62266 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1aQ62266 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1aQ62266 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms