Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Manf-201ENSMUST00000069036 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prm3Q62100 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms