Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt33bQ61897 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt33bQ61897 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt33bQ61897 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Krt33bQ61897 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt33bQ61897 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms