Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
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Ifi47Q61635 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifi47Q61635 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Ifi47Q61635 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Ifi47Q61635 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Ifi47Q61635 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms