Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1eQ61290 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms