Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc1Q61056 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trpc1Q61056 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc1Q61056 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc1Q61056 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc1Q61056 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc1Q61056 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms