Protein–RNA interactions for Protein: Q61009

Scarb1, Scavenger receptor class B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb1Q61009 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scarb1Q61009 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scarb1Q61009 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms