Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Neurod1Q60867 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms