Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Traf3Q60803 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms