Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms