Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med13Q5SWW4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med13Q5SWW4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med13Q5SWW4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med13Q5SWW4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med13Q5SWW4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med13Q5SWW4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med13Q5SWW4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med13Q5SWW4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med13Q5SWW4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med13Q5SWW4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Med13Q5SWW4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med13Q5SWW4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med13Q5SWW4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Med13Q5SWW4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Med13Q5SWW4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med13Q5SWW4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med13Q5SWW4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med13Q5SWW4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med13Q5SWW4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med13Q5SWW4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med13Q5SWW4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med13Q5SWW4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med13Q5SWW4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med13Q5SWW4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med13Q5SWW4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med13Q5SWW4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med13Q5SWW4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms