Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Znf608Q56A10 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Znf608Q56A10 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms