Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Fam220aQ3ZN08 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Fam220aQ3ZN08 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Fam220aQ3ZN08 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Fam220aQ3ZN08 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Fam220aQ3ZN08 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Fam220aQ3ZN08 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Fam220aQ3ZN08 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Fam220aQ3ZN08 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Fam220aQ3ZN08 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam220aQ3ZN08 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Fam220aQ3ZN08 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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